靶蛋白共价结合的分子,广泛用于活性基探针和共价药物。然而,这些共价抑制剂性能,经常受到功效和风险矛盾的影响,这需要在反应性和选择性之间取得平衡。当靶向蛋白质-蛋白质相互作用时,因为这些共价抑制剂的低配位性和不确定反应性,挑战更加明显。
近日,清华大学 化学系 Zichen Qin, Kaining Zhang,向宇Yu Xiang等,在Nature Chemistry上发文,报道了硫(VI)氟化物交换sulfur(VI) fluoride exchange (SuFEx) 体外选择,这一通用平台,从数万亿个硫(VI)氟化物交换SuFEx修饰的寡核苷酸中,高通量发现了蛋白质共价抑制剂。通过硫(VI)氟化物交换SuFEx体外筛选,还鉴定了共价抑制剂,并在SARS-CoV-2刺突蛋白与人血管紧张素转化酶2的蛋白-蛋白相互作用界面上,交联了不同SARS-CoV-2刺突蛋白残基。为了分离了一套单独的共价抑制剂,用于人补体C5蛋白。在这两种情况下,还观察到结合亲和力和交联反应性之间,存在明显的脱节,这表明直接寻找目标反应性(如硫(VI)氟化物交换SuFEx体外选择),对于发现高选择性和高效力的共价抑制剂,是至关重要的。Discovering covalent inhibitors of protein–protein interactions from trillions of sulfur(VI) fluoride exchange-modified oligonucleotides. 从数万亿硫(VI)氟交换修饰的寡核苷酸中,发现蛋白质-蛋白质相互作用的共价抑制剂。图1:硫(VI)氟化物交换sulfur(VI) fluoride exchange (SuFEx) 体外选择策略。
图2:基于硫(VI)氟化物交换SuFEx体外选择,发现了共价修饰SARS-CoV-2 S蛋白S1亚基的序列。
图3:在SARS-CoV-2 S 蛋白的RBD中,交联位点的鉴定。
图4: SF-Seq2,对SARS-CoV-2 S 蛋白S1亚基的反应性和选择性。
Qin, Z., Zhang, K., He, P. et al. Discovering covalent inhibitors of protein–protein interactions from trillions of sulfur(VI) fluoride exchange-modified oligonucleotides. Nat. Chem. (2023). https://doi.org/10.1038/s41557-023-01304-zhttps://www.nature.com/articles/s41557-023-01304-z声明:仅代表译者个人观点,小编水平有限,如有不当之处,请在下方留言指正!